No futuro próximo, um novo Êxodo começa, os remanescentes da civilização humana têm que deixar a Terra em declínio e começar a viajar para a Psicosfera. Aqueles que se autodenominam os Espíritos - novos pastores da raça humana, acreditam que um novo planeta, adequado para viver, será encontrado na Psicosfera. Cidades-arcas colossais, transportando centenas de colonos, têm viajado por séculos através de mundos hostis da Psicosfera sob a orientação dos Espíritos. O destino deles era a Nova Terra que substituiria sua antiga casa. Todos os mundos passados foram conectados por portais, foi assim que a Cadeia de Mundos foi criada.
Mas o fim dos testes difíceis não está à vista e, finalmente, devido ao despotismo dos Espíritos e às intrigas subterrâneas, o Êxodo foi desfeito. Novas facções surgiram - o Império e os Harkbacks. Cada facção tinha seus próprios objetivos e filosofia. Os Harkbacks acreditavam que a antiga Terra não havia morrido, e o Império - a facção mais misteriosa - acreditava que os humanos deveriam permanecer na Cadeia de Mundos. O antagonismo se transformou em uma guerra que tem perdurado por muitas décadas em muitos mundos.
Enquanto os Espíritos estão a caminho de seu destino e os Harkbacks estão buscando a mítica Terra, o Imperador constrói seu Império Esponja usando bases automáticas - seus Vice Quadros. Ele não acredita na antiga ou na nova Terra.
Secretamente, o Imperador cria o Espírito Mecânico - um supermecanismo para ajudá-lo a descobrir novos Mundos. Somente os inimigos mortais do Imperador, os Espíritos, poderiam descobrir novos mundos, e essa era a fonte de seu poder. Mas agora um novo tempo chegou.
Um dos Vice Quadros começa a testar esse mecanismo, o que leva ao surgimento de uma super mente - Messias Mecânico e a descoberta da Cadeia paralela dos Mundos da Psico-esfera. Também encontramos os Quadros do Êxodo "perdidos" e encontramos vestígios da misteriosa raça alienígena. Os três lados estão no meio da batalha mortal: o Flagelo contra os Escravos do Imperador, o Látigo dos Espíritos contra o Chamado do Messias, uma verdade morta contra uma mentira recém-nascida.
Quem são os Espíritos - salvadores ou assassinos da raça humana? Quem é Messias - juiz ou marionete? Quem é o Imperador? Quem vencerá? O jogador descobrirá a resposta durante a espetacular campanha para um jogador em Perimeter: Emperor's Testament.
"Sinto uma fome de tensão das esferas mais altas. Carne e sangue da Esponja foram postos em movimento; eles estão pulsando ao redor do mundo em que o Imperador está criando uma nova história da grande Cadeia."
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